Если продадите одним договором, то все будет так, как Вы написали.
Если оформите сделку двумя договорами, то вычет каждому из Вас будет 1 млн. руб., т.е. налога не будет вообще.
Подать налоговую декларацию нужно будет в любом случае.

Коллеги, спор на эту тему идет давно и безрезультатно. Позиции Минфина и Конституционного суда прямо противоположны. В позиции Минфина утверждается, что при самостоятельной продаже каждым сособственником своей доли в праве каждому из них полагается налоговый вычет в полном объеме. КС считает иначе, вот выдежки из постановления:
ПОСТАНОВЛЕНИЕ
от 13 марта 2008 г. N 5-П
"......Жилищный кодекс Российской Федерации объектами жилищных прав признает жилые помещения, т.е. изолированные помещения, которые являются недвижимым имуществом и пригодны для постоянного проживания граждан, а именно отвечают установленным санитарным и техническим правилам и нормам, иным требованиям законодательства (части 1 и 2 статьи 15), и относит к жилым помещениям жилой дом, часть жилого дома, квартиру, часть квартиры, комнату (часть 1 статьи 16). Следовательно, жилищное законодательство не рассматривает часть комнаты в качестве самостоятельного объекта жилищных отношений.
...........По смыслу положений подпункта 1 пункта 1 статьи 220 Налогового кодекса Российской Федерации, граждане вправе продавать жилые помещения, являющиеся как единым объектом права общей долевой собственности, так и выделенными из них в натуре долями, признаваемыми объектом индивидуальной, а не общей долевой собственности, и получать при этом право на имущественный налоговый вычет в сумме, не превышающей 1 000 000 рублей (при нахождении имущества в собственности менее трех лет)."
Таким образом получается, что все из Вас правы. Хотя КС все-таки "главнее" Минфина.
Но клиенту нужен конкретный результат в конкретном регионе. Поэтому справки по этому вопросу, чтобы не влипнуть, наводить надо в своей налоговой.
Одно могу сказать точно: если квартира не однокомнатная, то определив в ней порядок пользования и продав ее по комнатам отдельными договорами, эти два продавца на налоги не попадают ни с точки зрения Минфина, ни с точки зрения КС.

Спасибо всем за ответы. Как вижу, единого мнения нет:-)
По вашим наводкам пошел читать ст. 220 НК РФ, и нашел к нему два комментария от налоговой службы:


Старый комментарий от 24.08.2012 - http://www.nalog.ru/about_nalog/3962563/
Таким образом, при продаже квартиры как единого объекта права собственности, находившейся в общей долевой собственности трех человек менее трех лет, имущественный налоговый вычет в размере 1 000 000 рублей распределяется между совладельцами этого имущества.



А вот новый комментарий от 07.08.2013 - http://www.nalog.ru/about_nalog/4216155/

Если каждый владелец 1/3 доли в праве собственности на квартиру продал свою долю, находившуюся в его собственности по отдельному договору купли-продажи, он вправе получить имущественный налоговый вычет в размере 1 000 000 рублей.



Т.е. можно оформить 2 ДКП по 1 млн, и не заплатить налог, т.к. все покроют два вычета по одному миллиону.
К тому же, т.к. квартира была куплена родителями более 3 лет назад, то маме в любом случае платить не надо будет.

Еще раз спасибо.

А покупателю двух долей будет больше проблем с оформлением свидетельства регистрации или нет?

Надежнее двумя ДКП.

Смотрю на комментарии специалистов и удивляюсь. Поясняю еще раз: налогом облагается сумма превышающая 1 млн. руб. от стоимости объекта недвижимости. Ошибочно считать, что если ВЫ продаете только долю квартиры и оцениваете ее в 1 млн. руб., то налога не будет.
При продаже 1/2 доли квартиры налогом будет облагаться сумма свыше 500 тыс. руб.
Уважаемые господа специалисты не подставляйте своих клиентов под налоги.

К вышесказанному могу добавить, что можно и по одному ДКП продать, не выплачивая налог, для этого необходимо в ДКП прописать сумму не выше 1млн, вторую часть получить по расписке. Оформляется не так сложно, множество объектов продается именно так. Одно НО: желательно искать покупателя с наличкой

Двумя договорами, но специалиста для этого все равно привлеките.

Делайте два договора купли-продажи по 1/2 доли квартиры, но между договорами необходимо сделать интервал, хотя бы дней 20, это нужно для большей уверенности, что налога не будет.

Здравствуйте, Ренат! Ваша ситуация регламентируется ст. 220 НК РФ:
При определении размера налоговой базы... налогоплательщик имеет право на получение следующих имущественных налоговых вычетов:
1) в суммах, полученных налогоплательщиком в налоговом периоде от продажи жилых домов, квартир, комнат, включая приватизированные жилые помещения, дач, садовых домиков или земельных участков и долей в указанном имуществе, находившихся в собственности налогоплательщика менее трех лет, но не превышающих в целом 1 000 000 рублей;
Поэтому, если вначале будет 1 договор на 1/2 доли, а потом, после его регистрации - другой - в каждом договоре можно указать по 1 млн. руб., и налогов при этом не возникнет - таковы разъяснения МинФина...
Если же оформлять 1 договором - да, будет налог с суммы, превышающей 1 млн. руб.

Здравствуйте! Первое, что хочу сказать, расчет налоговой базы отталкивается от объекта (а не от физ лиц), то есть Вам нет смысла дробить продажу квартиры по долям.У Вас 2 варианта: 1) продать квартиру показывая в ДКП фактическую стоимость в 2 млн и заплатить налог (130т.р. на двоих). 2) продать квартиру показывая в ДКП 1 млн и не платить ничего. Покутелю выгодно купить за 2 млн(в случае если он не получал ранее налоговый вычет, такое право предоставляется 1 раз- при покупке). Вывод: если Покупатель не намерен возмещать вычет по каким либо причинам, предложите показать в ДКП квартиры 1млн , если все же Покупатель планирует воспользоваться правом вычета, предложите указать в ДКП квартиры 1,5 млн, в этом случае Вы(Продавцы) заплатите налог с 500т.р.-это 65т.р.(на двоих) и будете спать спокойно.(расписку на 500т.р. не пишите, в крайнем случае -обязательство). Успехов!